樹木根系深入土層的深淺和范圍與樹木的生長、開花、結實等有著密切的關系，而影響根系分布深度的主要條件是土層的有效厚度和理化性質。栽植前的挖穴雖然達到了相當的深度，但隨著樹木的生長，穴壁以外緊實土壤的不良性狀就會妨礙根系的生長和營養的吸收。
深挖土壤并結合施用適量的有機肥是改良土壤肥力的最好方法。但是，如果把有機質盲目地施在潮濕或極酸的貧瘠土壤中，深挖施肥并不能獲得令人滿意的效果。在這種情況下，必須通過地下排水或通過挖掘爆破等方式，打破地下不透水層，排除過多的漬水，或通過底土施用石灰克服極酸的障礙，促進微生物的活動和有機質的分解，加速土壤熟化，使難溶性物質轉化成有效的養分。
深挖的深度與地區、土壤、樹種及深挖的方式有關。黏重土壤應挖得較深，沙質土壤可適當淺挖；地下水位高時宜淺挖，下層為半風化的巖石時則宜加深，以增厚土層；深層為礫石，也應深挖，揀出礫石并換好土，以免肥、水淋失；地下水位低、土層厚、栽植深根性樹木時則宜深挖，反之宜淺；下層有黃淤土、白干土、膠泥板或建筑地基等殘存物時，挖的深度以打破此層為宜，以利滲水。
可見，深挖的深度要因地區、因樹種而異，在一定范圍內挖得越深效果越好，一般為60至100厘米，最好距離根系主要分布層稍遠一些，以利根系向縱深生長，擴大吸收范圍，提高根系的抗逆性。此外，環狀深挖與輻射深挖可深一些，全面深挖應淺些，而且要掌握離干基越近越淺的原則。
土壤深挖應結合施肥（主要是有機肥）和灌溉進行。挖出的土壤經打碎，清除磚石雜物后最好與肥料拌勻以后回填。如果土壤不同層次的肥力狀況相差懸殊，則應將表土層的土壤回填在根系密集層范圍內，心土放在表層。這樣不但有利于根系對養分的吸收，促進根系的快速恢復和生長，而且有助于心土的熟化。